В настоящий момент (12.08.2011 г.) фонды музея (основной - 2380; научно-вспомогательный - 2857) насчитывает 5237 единиц хранения. Формирование фонда музея началось ещё задолго до появления самого музея: начиная с утверждения плана мероприятий по открытию музея в 1968 году - к 20-летию города Салават, когда за каждым из членов оргкомитета по организации музея истории города были закреплены учреждения, от которых следовало получить материалы для музея. В дальнейшем, в результате целенаправленной собирательской деятельности сотрудников музея, был собран достаточный материал для составления к настоящему моменту 18 коллекций.

Крупнейшие из них: 

- Коллекция «Документальная» насчитывает более 2500 ед. хр. и включает в себя материалы по строительству г. Салават, о его активных участниках - первостроителях города; материалы о городе различного характера; личные архивы знаменитых и известных людей города и пр.

- Коллекция «Археология и ВИД (вспомогательные исторические дисциплины)» насчитывает около 700 ед. хр., включает в себя:

- Археологию,

- Бонистику (денежные знаки),

- Вексиллологию (флаги, знамёна, вымпела и т.д.), 

- Сфагистику (печать, штемпель, матрица, печатка),

- Фалеристику (ордена, медали, нагрудные знаки, значки)

- Нумизматику (монеты),

- Почтовые принадлежности, филателию.

Наиболее полно представлены разделы «фалеристика» и «нумизматика».

В постоянных экспозициях музея широко представлен краеведческий материал по истории возникновения и развития города. 

Музей насчитывает 7 постоянных экспозиций:

- История города и предприятий;

- Этнография и материальная культура народов Республики Башкортостан;

- Русская изба;

- Башкирская юрта;

- Природа и животный мир Предуралья;

- Салават Юлаев – поэт-импровизатор;

- Инсталляция «Начало строительства»;

- Кабинет Березовского – директора комбината №18.

Формы научной деятельности:

Проведение научно-исследовательской работы по следующим основным направлениям:

- разработка научной концепции музея;

- история одного экспоната;

- краеведение.

- участие в научных конференциях с последующей публикацией статей в научных сборниках.

Формы экскурсионной деятельности разнообразны и их круг постоянно обновляется в соответствии с запросами населения города:

- экскурсии по постоянным экспозициям и временным выставкам, городские экскурсии;

- интеллектуальные викторины;

- игры;

- этнографические аукционы и свадьбы с элементами обрядности;

- уроки мужества;

- встречи с интересными людьми;

- презентации;

- мастер-классы и др.

О необходимости создания в городе музея истории города одним из первых выступил 1 июля 1960 года в газете «Ленинский путь» историк и краевед Газиз Мухамедьянович Галин. И в сентябре 1966 года постановлением бюро горкома КПСС был утвержден оргкомитет по организации музея истории города Салавата. Бюро поручило исполкому горсовета в месячный срок изыскать помещение для музея. Был принят и утвержден план мероприятий по открытию музея в 1968 году - к 20-летию города. Но дело с места не тронулось.

Вопрос об открытии музея вновь был рассмотрен в 1986 году. В связи с чем, началась реконструкция первого этажа жилого дома №3 по ул. Первомайской. Жители города приносили предметы для будущего музея истории города.

15 сентября 1989 года открылся музей - выставочный зал, волею судеб ставший впоследствии Салаватской Картинной галереей. А историко-краеведческий музей был создан только через 20 лет. 

В 2004 году принято Постановление главы Администрации г. Салавата Ю.Б. Алимова от 13.02.2004 г. о разрешении проектирования реконструкции кинотеатра «Родина», расположенного по ул. Первомайской, д. 18 под историко-краеведческий музей с выполнением благоустройства сквера в целях сохранения исторического и культурного наследия г. Салавата, формирования и удовлетворения духовных потребностей населения города. Кинотеатр «Родина» (здание будущего историко-краеведческого музея) был открыт 21 февраля 1953 года. Это первый кинотеатр поселка Салават Юлаев. Построен он по типовому проекту ленинградского архитектора Зои Осиповны Брод.

Однако приведение его в исполнение затягивалось, предлагались другие здания. Но под нажимом общественности и по настоятельной рекомендации Министерства Культуры и Национальной политики Республики Башкортостан, в здании кинотеатра «Родина» началась реконструкция. В декабре 2008 года был подписан акт приема здания после реконструкции. С января 2009 года начались работы по оформлению музея. Над художественным решением залов музея работали художники-оформители ООО «ХПМ «Художник Башкортостана». Сотрудниками музея разрабатывались экспозиции музея. Методическая помощь в разработке экспозиций оказывалась Чишковой Л.А., заместителем генерального директора по научной работе Национального музея РБ. Итогом стало открытие 12 июня 2009 года Салаватского историко-краеведческого музея.

Жители города Девлетов Рузвельт Аметович и Кадесников Борис Павлович по крупицам собирали материалы по истории города, встречались с первостроителями, их семьями. На протяжении многих лет, обращаясь в различные инстанции, Рузвельт Аметович долгие годы добивался открытия в городе историко-краеведческого музея.

Большой вклад в формирование фондов внесли жители города: Потеряхин В.А., Захарова Л.С., Ишмухаметова Н.С., Богданова Л.Г., Степанова З.В., Мусийчук Е.И., Сингай Е.А., Пискунов В.А., Константинова С.В., Хамзина Ф. Ш., Шадзевская В.А. , Сагитов Р.М. , Зубаиров Р.М., Газизов М.Ф., Сафиканов Р.Б., Азнагулов В.К., Хуснутдинов Р.А., Музычко О.Н., Баутина Л.Б., Федорова Н.С., Родионов В.В., Лункин И.В., Крейц В.П., Барановская А.В., Киреев Н.М., Усманов Г.А., Колышев Т.Г., Рябов Г.Т., Бареев Ю.П., Асабина О.А., Ляшик Э.Н., сёстры Субхангуловы, Давыдков В.К., Павлова В.Н., Шамаева Б.Х. и многие другие.

В экспозиции «Башкирская юрта» использованы экспонаты, переданные в дар этнографическим музеем школы-интерната г. Салават.

Лобановым Г.Г., бывшим руководителем историко-краеведческого музея МОУ «СОШ №14», переданы в дар музея личные вещи Героя Советского Союза Бекетова В.С., а его сыном – Лобановым В.Г. - бюст героя.

Семьёй Ахметовых подарены музею уникальные деревянные скульптуры и графические работы сына Явдата. 

Благодаря Дублистовой Нине Афанасьевне, администратору кинотеатра «Родина» с 1971-2005 гг., сохранен и передан музею ценный архивный материал по истории кинотеатра (альбомы, Книга Почета, Книга посетителей, фотографии), Переходящее Красное Знамя Салаватского горкома КПСС и исполкома горсовета народных депутатов.

«Совет старейшин» и «Совет товаропроизводителей» постоянно контролировали и грамотно направляли работу сотрудников музея по созданию экспозиций, отражающих историю городских предприятий, организаций и учреждений.

Залы музея украшают макеты переселенных деревень, созданные членом ОО «Аллагуват» Раимовым Миниахметом Гиззатовичем.

В основу оформления экспозиций легли фотографии Чернова К.П., Сивохина А.И., Губина А.А.