С 1993 года музей является филиалом Национального музея Республики Башкортостан. В 1994 году была создана экспозиция, посвященная жизни и научной деятельности лидера башкирского национального движения, востоковеда-тюрколога, доктора философии, профессора, почетного доктора Манчестерского университета Ахметзаки Валидова.

В экспозиции представлены более 1500 экспонатов, среди которых личные вещи, документы, фотографии А. Валиди. Большую ценность представляют прижизненные научные издания, профессорская мантия, дипломы, полученные в различных университетах Европы.