После окончания средней школы поступил в Уфимское училище искусств на художественное отделение, которое он закончил в 1989 году, получив специальность художника — оформителя. В 1991 – 1995 годы учился на актёрском отделении театрального факультета Уфимского Государственного института искусств имени Загира Исмагилова. После успешного завершения учебы Юмагулов направляется на работу в Башкирский государственный академический театр драмы им. М.Гафури. В театре он проработал до 1997 года, исполнив ряд главных ролей в спектаклях по пьесам классиков мировой драматургии, а также национальных авторов. В этот период пробовал себя и в театральной режиссуре, поставив на сцене академического театра детский спектакль «Курай». Однако его больше влекла кинорежиссура и в 1997 году он поступает на учебу во Всероссийский государственный институт кинематографии им. С.А. Герасимова на отделение режиссуры игрового кино в мастерскую кинорежиссёров Карена Шахназарова и Андрея Эшпая.
После завершения учёбы работает на киностудии «Башкортостан». Снял документальные ленты «Мустай Карим» для телеканала «Культура», «Великий голод» совместно с американским режиссером Остином Хойтом для телеканала American Experience (США), «Мусульмане Башкортостана сегодня», который участвовал в 9-ом Международном кинофоруме «Мир глазами женщин» в г. Улан-Батор. В этот период по приглашению столичных кинокомпаний А. Юмагулов принимает участие в качестве режиссёра–постановщика в съёмках сериалов, таких как «Улица разбитых фонарей», «Дорожный патруль» (НТВ) кинокомпания «Форвард-Фильм», «Невидимки» (ДТВ) компания «Партнер», «След» (ОРТ) компания «ТелеРоман».
В октябре 2010 года состоялась премьера полнометражной картины Юмагулова «Ловец ветра». Фильм имел огромный зрительский успех, премьерный показ был осуществлен одновременно в 14 городах и районных центрах республики. Фильм имел также и фестивальный успех и был удостоен следующих наград: Приз VI Международного фестиваля мусульманского кино в г. Казань «За лучший сценарий»; Специальный приз жюри «За воплощение темы нравственной красоты человека» VII Международного фестиваля военно-патриотического фильма им. С.Ф. Бондарчука «Волоколамский рубеж» в г. Волоколамск; Приз зрительских симпатий «Серебренная тайга» IX Международного фестиваля дебютных фильмов «Дух огня» в г. Ханты-Мансийск, приз зрительских симпатий Чебоксарского международного кинофестиваля, посвященного кинематографу малых народов в 2011 г., диплом XIII Евразийского телефорума «За талантливый сценарий и режиссуру в комедийном жанре».
В 2011-2013 годы работает художественным руководителем ГУП РБ киностудия «Башкортостан».
С октября 2010 года и по декабрь 2014 года Айсыуак Юмагулов являлся Председателем Союза кинематографистов Башкортостана. Является членом Правления Союза кинематографистов Российской Федерации.