Крупнейшая концертная организация республики имеет богатую историю.  Днем ее рождения  считается 20 января  1939 года, когда  Постановлением Совета народных комиссаров БАССР было решено открыть в  Уфе новое учреждение  культуры.

Целью  создания Башкирской  государственной  филармонии стало формирование и удовлетворение духовных потребностей населения республики в сценическом, музыкальном, хореографическом искусстве; широкая пропаганда лучших образцов русской и европейской музыкальной и литературной классики, музыки народов республики, народного творчества и произведений современных композиторов и писателей среди народных масс.
В начальные годы филармония принимала таких выдающихся музыкантов России, как Святослав Рихтер, Даниил Шафран, Андрей Корсаков, Квартет имени Бородина, органист Олег Янченко, Наум Латинский, Татьяна Гринденко.

1980-е годы стали началом развития джазового движения в Уфе. Тогда профессионализм и мастерство блестящего джазового коллектива "Дустар" во главе с саксофонистом Маратом Юлдыбаевым привлекли внимание уфимцев. Следующее поколение джазменов в лице саксофониста Олега Киреева облекло джазовые устремления слушателей в форму фестиваля. Ежегодно, весной на несколько дней Большой зал филармонии превращается в джазовую Мекку, куда стремятся поклонники "беспокойного детища XX века" – джаза. В 1998 году был создан Эстрадно-джазовый оркестр Башкирской Государственной филармонии, Георгию Маркорову  предложили возглавить его. В последние десятилетия оркестр стал одним из самых востребованных коллективов филармонии (руководитель Олег Касимов).

Сегодня на эстрадной сцене блистают настоящие кумиры публики – певцы Флюра Кильдиярова, Идрис Газиев, Назифа Кадырова, Вахит Хызыров, Фадис Ганиев, Римма Амангильдина, Лилия Ишемьярова, кураист Азат Аиткулов, органист Владислав Муртазин. Отдельную страницу в истории филармонии занимают коллективы, пропагандирующие башкирскую музыкальную культуру в оригинальной интерпретации. Это фольклорно-эстрадные группы «Ядкар» («Наследие»), «Каравансарай» и «Далан» («Удача»), «Ихлас» («От всей души»). Огромную зрительскую любовь снискали юмористические выступления коллектива «Кызык-Мэзэк».
 
Большие надежды филармония связывает с молодым коллективом - Национальным оркестром народных инструментов (художественный руководитель – народный артист РБ Рамил Гайзуллин), в состав которых вошли лучшие музыканты и творческая молодежь республики.

Здание Башкирской государственной филармонии среди достопримечательностей столицы Башкортостана занимает особое место. Это гармоничный архитектурный комплекс с элементами неоклассицизма. На сегодняшний день Башкирская государственная филармония имеет два концертных зала: Малый (Органный) , рассчитанный на 300 мест, и Большой зал на 633 места.

В 1948 г. открылся Концертный зал (ныне Малый зал), в котором в 1986 г. был установлен орган немецкой фирмы «Sauer».

В 1984 г. состоялось открытие Большого зала Башкирской государственной филармонии.

Сегодня в этом зале проводятся праздники музыки – Международный фестиваль камерной и симфонической музыки, Международный джазовый фестиваль  «Розовая пантера». На  этой сцене блистательно  выступали  Национальный  филармонический оркестр России и Государственный камерный оркестр «Виртуозы Москвы» под управлением Владимира Спивакова, Государственный симфонический оркестр «Новая Россия» и Камерный оркестр «Солисты Москвы» под управлением Юрия Башмета, солисты Дмитрий Хворостовский, Денис Мацуев, Граф Муржа, Аркадий Шилклопер и многие другие.