Башкирский государственный природный заповедник (БГПЗ), образованный 3 сентября 1929 года, располагается на землях Бурзянского, Абзелиловского и Белорецкого районов Республики Башкортостан. Общая площадь которых составляет 49 609 га, охранная зона отсутствует. Центральная усадьба находится в поселке Саргая Бурзянского района.
Территория заповедника представлена двумя ландшафтными районами: хребтами Уралтау и Южный Крака, резко отличающимися друг от друга. Между ними расположена переходная область – долина реки Южный Узян, бассейна реки Белая и питается водами многочисленных речек, ручьев и ключей. Озер в заповеднике нет, но в поймах рек встречаются многочисленные старицы. Климат резко континентальный. Среднегодовая температура +6 °С, абсолютный max +35,9 °С, min –48,6 °С; количество осадков – 587 мм. Преобладают юго-западные и западные ветры.
Леса занимают около 80 процентов всей площади заповедника. Сосновые леса представляют эталонные сообщества зоны светло-хвойных лесов Южного Урала и имеют особое значение для сохранения биологического разнообразия. На территории заповедника охраняется более 800 видов высших сосудистых растений. Из них особой охране подлежит 111 видов из 40 семейств и 87 родов; 37 видов растений, произрастающих на территории БГПЗ, занесены в Красную книгу Российской Федерации, 256 – в Красную книгу Республики Башкортостан. Половина из 35 видов орхидных растений Башкортостана растет на территории БГПЗ: венерины башмачки настоящий, крапчатый и крупноцветковый; каллипсо луковичный, ятрышник обожженный и другие. Остатки флоры прежних эпох особенно часто встречаются на каменистых склонах горных хребтов.
Мозаичность ландшафтов Южного Урала, расположение заповедника на стыке Европы и Азии определяют высокое разнообразие животного мира.
В заповеднике охраняется 57 видов млекопитающих, 193 вида птиц, 6 видов рептилий, 3 вида амфибий, 16 видов рыб. Обычными млекопитающими являются: бурый медведь, рысь, волк, марал, лось, куница и др. В Красную книгу России занесены 15 видов позвоночных животных, обитающих на территории заповедника (птицы и рыбы); 35 видов позвоночных животных занесены в Красную книгу Республики Башкортостан.
Из занесенных в Красную книгу России на территории БГПЗ обитают: беркут, орел-могильник, орлан-белохвост, сапсан, филин, хариус европейский, форель ручьевая, подкаменщик обыкновенный, таймень, пчела-плотник, дыбка степная, аполлон обыкновенный, мнемозина и др.
На территории заповедника зарегистрированы более 2000 видов беспозвоночных животных. Из них в Красную книгу Республики Башкортостан занесены 12 видов, в Красную книгу России – 4 вида.
Уникальными объектами на территории заповедника являются:
- мигрирующая популяция лосей;
- локальная популяция маралов;
- гора Башарт;
- место паломничества рода тамьян.
В 1966 году в поселке Саргая – центральной усадьбе заповедника – организован Музей природы из шести комнат. Только за последние пять лет его посетило более 5000 человек.
В заповеднике оборудована экологическая тропа протяженностью два километра. Также действует экологическая тропа протяженностью два километра на кордоне им. Макарова.
Башкирский заповедник тесно сотрудничает с Всемирным фондом дикой природы (WWF).